Detection of new SARS-CoV-2 variants related to mink

Data di pubblicazione: 12/11/2020
Ambito sintetico: Malattie xoonotiche

Sintesi a cura dell'Università di Parma: 

Identificazione di una nuova variante di SARS-CoV-2 correlata ai visoni

Gli specialisti dell'EFSA in materia di salute animale hanno contribuito a una valutazione rapida dei rischi per la salute umana derivanti dalle nuove varianti della SARS-CoV-2 nel visone, in collaborazione con il Centro europeo per la prevenzione e il controllo delle malattie.

Nell’aprile 2020 è stata segnalata nei Paesi Bassi la prima infezione da SARS-CoV-2 in un visone e successivamente in un allevatore di visoni, identificando la possibilità di trasmissione da uomo a visone e viceversa (1). Da allora, sono state segnalate infezioni nei visoni in Danimarca, Italia, Spagna, Svezia e Stati Uniti (2).

Il 5 novembre 2020, la Danimarca ha segnalato 214 casi umani di COVID-19 infettati da varianti del virus SARS-CoV-2 relative al visone, così come la presenza di visoni infetti in più di 200 allevamenti di visoni. La maggior parte dei casi umani e animali segnalati dal Giugno 2020 è stato nella regione dello Jutland settentrionale. Le varianti SARS-CoV-2 rilevate in questi casi facevano parte di almeno cinque cluster strettamente correlati; ogni cluster era caratterizzato da una specifica variante correlata al visone, identificata in uomini e animali provenienti da allevamenti di visoni infetti. La Danimarca ha implementato solide misure di risposta per controllare il focolai nei visoni e diminuendo la possibilità di circolazione tra i reservoir umano e animale.

I visoni sono alloggiati in gabbie contigue fatte di rete metallica, che consentono il libero flusso d'aria e il contatto tra gli animali all'interno gabbie adiacenti, il che spiega la rapida trasmissione da animale ad animale. Inoltre, la presenza di RNA virale nella frazione della polvere inalabile raccolta all'interno degli allevamenti indica la possibilità che i lavoratori siano stati esposti al virus nelle escrezioni di visone. A seguito di focolai di infezione da SARS-CoV-2 negli allevamenti di visoni nei Paesi Bassi nel 2020, il si devono tenere presenti i punti seguenti.

• La trasmissione da visone a visone è molto efficiente.
• Non è stato identificato alcun collegamento tra gli allevamenti infetti.
• Una percentuale di animali da allevamento presentava sintomi clinici indicativi di malattie respiratorie acute per circa quattro settimane, ma alcuni animali erano ancora RT-PCR-positivi per SARS-CoV-2 nei tamponi faringei dopo la scomparsa dei sintomi clinici. Ciò può variare, come si è visto di recente nei focolai danesi, dove i sintomi clinici sono stati osservati per periodi più brevi.
• L'elevata diversità nelle sequenze di alcuni allevamenti di visoni può probabilmente essere spiegata dall'esistenza di molte generazioni di animali infetti prima che fosse osservato un aumento della mortalità.
• Le stime attuali indicano che il tasso di sostituzione di SARS-CoV-2 è di una mutazione ogni due settimane. C'era anche una diversità di sequenza relativamente alta osservata negli allevamenti, che è risultata negativa fino ad una settimana prima dell'insorgenza dell’epidemia, il che implica che il virus si evolve più rapidamente nella popolazione di visoni. Ciò può indicare che il virus potrebbe replicarsi più efficacemente nel visone o che possa aver acquisito mutazioni che lo rendono più virulento nel visone.

Uno dei cluster (Cluster 5), che è stato segnalato come circolante ad agosto e settembre 2020, è correlato a un variante con quattro modificazioni genetiche, tre sostituzioni e una delezione, nella proteina spike (S). Poiché la proteina S contiene il dominio di legame del recettore, ed è un obiettivo principale per la risposta immunitaria, tali mutazioni potrebbero, in teoria, avere delle conseguenze sulla fitness virale (capacità di infettare esseri umani e animali),sulla trasmissibilità e l’antigenicità. Di conseguenza, l'evoluzione dei virus con crescenti cambiamenti nei domini funzionali della proteina S potrebbe influenzare il trattamento, alcuni test diagnostici e l’antigenicità del virus. Potrebbe anche avere un impatto sull'efficacia vaccini già in fase di sviluppo e, eventualmente, richiederne l'aggiornamento. Sono in corso indagini e studi per chiarire la portata di queste possibili implicazioni.

Qual è il rischio per la salute umana delle varianti di SARS-CoV-2 correlate ai visoni?

Trasmissibilità

I dati sulle varianti SARS-CoV-2 relative al visone provenienti da Danimarca e Olanda indicano come queste varianti siano in grado di circolare rapidamente negli allevamenti di visoni e nelle comunità umane vicine agli allevamenti, tuttavia, non sembrano essere più trasmissibili di altre varianti circolanti di SARS-CoV-2. Quindi, la probabilità di l'infezione da ceppi varianti correlati al visone è valutata come bassa per la popolazione generale, moderata per le popolazioni in aree con un'alta concentrazione di allevamenti di visoni e molto alta per gli individui con esposizione professionale.

Gravità

I pazienti che sono stati infettati da varianti correlate al visone, inclusa la variante Cluster 5 in Danimarca, non sembrano avere sintomi clinici più gravi rispetto a quelli infettati da varianti non correlate al visone. Quindi, l'attuale impatto del COVID-19 sulla gravità della malattia nei pazienti infetti da qualsiasi variante correlata al visone sembra essere simile a quello di pazienti infettati con varianti non correlate al visone. Questo impatto era stato precedentemente valutato come basso per la popolazione generale e molto alto per gli individui con fattori di rischio per la forma grave della malattia COVID-19, come gli anziani .

Immunità, reinfezione, vaccinazione e trattamento

Di tutte le varianti correlate al visone analizzate finora, solo la variante Cluster 5 ha sollevato preoccupazioni specifiche a causa del suo effetto sull’antigenicità. Sono necessarie ulteriori indagini per valutare se ciò possa avere un impatto i) sul rischio di reinfezione, ii) ridotta efficacia del vaccino o iii) ridotto beneficio del trattamento con plasma da pazienti convalescenti o con anticorpi monoclonali. Va tenuto presente che la trasmissione continua di SARS-CoV-2 negli allevamenti di visoni può eventualmente dar luogo ad altre varianti del virus che possono destare preoccupazione.

Diffusione transfrontaliera

La diffusione transfrontaliera delle varianti SARS-CoV-2 correlate al visone nei paesi dell'UE e nel Regno Unito attraverso l'uomo non è stata finora osservata, ma non vi è alcuna indicazione che il potenziale di diffusione transfrontaliero sia diverso da quello osservato per altre varianti SARS-CoV-2. L'adattamento genetico nelle popolazioni di visoni potrebbe dare origine a un vantaggio selettivo in regioni con attività di allevamento di visoni. La mutazione Y453F, che definisce varianti correlate al visone, è stata individuata al di fuori dell'Europa, indicando il potenziale di circolazione di tali ceppi. Negli ultimi mesi, la trasmissione è avvenuta in Danimarca e, in una certa misura, nei Paesi Bassi, il che potrebbe portare a una diffusione oltre i confini nazionali. La diffusione transfrontaliera delle varianti SARS-CoV-2 relative al visone nei paesi dell'UE e nel Regno Unito attraverso gli animali e i prodotti animali sembra essere molto bassa.

Conclusioni

Sulla base delle informazioni attualmente disponibili su trasmissibilità, gravità, immunità e diffusione transfrontaliera, il livello complessivo di rischio per la salute umana rappresentato dalle varianti correlate al visone SARS-CoV-2 può essere determinato come:

• basso per la popolazione generale e moderato per gli individui vulnerabili dal punto di vista medico, similmente a quanto riportato per gli altri ceppi di SARS-CoV-2 (non correlati al visone);
• basso per la popolazione generale in aree con un'alta concentrazione di allevamenti di visoni e da moderato ad alto per individui medicalmente vulnerabili che vivono nelle stesse aree;
• moderato per individui non vulnerabili dal punto di vista medico con esposizione professionale;
• molto alto per individui clinicamente vulnerabili con esposizione professionale.

Se le preoccupazioni sollevate relativamente all'immunità, reinfezione, vaccinazione e trattamento saranno confermate, la valutazione del rischio sarà immediatamente riesaminata per rivalutare il livello generale di rischio per la salute umana e le potenziali implicazioni per la diagnosi, il trattamento e lo sviluppo del vaccino COVID-19. Ciò vale anche per eventuali ulteriori varianti correlate al visone con mutazioni nella proteina S che possono insorgere e diffondersi nell'UE e nel Regno Unito.

Riferimenti bibliografici

1. Statens Serum Institut. Risikovurdering af human sundhed ved fortsat minkavl. 3 November 2020. Copenhagen: Statens Serum Institut; 2020.
2. World Organisation for Animal Health. COVID-19 Portal. Events in animals [cited 11 November 2020]. Available from: https://www.oie.int/en/scientific-expertise/specific-information-andrecommendations/questions-and-answers-on-2019novel-coronavirus/events-in-animals/

Link: https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/RRA-SARS-CoV-2-in-mink-12-nov-2020.pdf