La Legge n. 131/2003 affida alle sezioni regionali della Corte dei Conti funzioni di controllo collaborativo sulla sana gestione degli enti autonomi territoriali e sul funzionamento dei controlli interni, finalizzate ad ottimizzare l´azione amministrativa. Nell´ambito del predetto rapporto collaborativo, il CAL, in particolare, è espressamente chiamato a farsi partecipe delle "ulteriori forme di collaborazione" da svilupparsi con la Sezione regionale di controllo e con la Regione.

È stata pertanto sottoscritta la “Convenzione sulle attività di collaborazione in merito all´esercizio della funzione di controllo collaborativo di cui alla Legge n. 131 del 2003", che ha portato alla definizione di modalità di collaborazione condivise tra Regione Emilia-Romagna, Consiglio delle Autonomie Locali e sezione regionale di controllo della Corte dei Conti.